In der berühmten Bibliothek von Alexandria lehrt im Jahre 391 die Philosophin und Astronomin Hypatia (Rachel Weisz), die Tochter des Bibliotheksleiters Theon (Michael Lonsdale). Zu Hypatias Schülern gehören sowohl Heiden als auch Juden und Christen. Auf dem Marktplatz, der Agora, werden die Christen jedoch immer zahlreicher. Nach blutigen Auseinandersetzungen lässt der römische Stadtpräfekt die Bibliothek und das Serapeum genannte Heiligtum für die Christen freigeben. Obwohl Hypatia versucht, möglichst viele Werke aus der Bibliothek zu retten, werden die meisten von ihnen von wütenden Christen zerstört.
Religion als Unterdrückung diffamiert
„Agora – Die Säulen des Himmels“: Ein bewusst antichristlicher Film, der Fakten nach Belieben gewichtet und auslegt